TV1=1968年 第1作／TV2=1971年 第2作／TV3=1985年 第3作／TV4=1996年 第4作／TV5=2007年 第5作／TV6=2018年 第6作／MOVIE=劇場版・実写映画。複数の資料を編者が読み比べて確認できた範囲のみ表示している。話数が非常に多いシリーズのため、記載漏れは十分にあり得る。
水木しげる『ゲゲゲの鬼太郎』シリーズは1960年代の連載開始から半世紀以上、アニメも6期にわたって続いている。まず、この台帳の妖怪図鑑にも記事がある妖怪のうち、鬼太郎シリーズへの実際の登場が確認できたもの（31体）をまとめる。
アニメ版では妖怪城の住人として、蛇のように操る髪で獲物を捕らえる姿で登場する。
アニメ版では、喧嘩の末に斬り合った三つの首が集まって生まれたという設定で登場する。
アニメ版では、コマ回しを得意とする妖怪として、子供好きな一面も描かれる。
最新アニメ版（東映アニメーション公式サイト掲載）でゲゲゲの森に住む妖怪として登場する。
水木しげる『ゲゲゲの鬼太郎』のキャラクターとして、原作初期から登場し全国的に有名になった。
アニメ『ゲゲゲの鬼太郎』シリーズを通じて、行く手を塞ぐ壁の妖怪として登場する。水木の造形は独自の創作。
アニメ版では、第3作以降に鬼太郎と和解し、海の仲間として再登場する回もある。
アニメ版では、1980年代以降ゲゲゲの森の村長格として登場する。将棋好きな設定が加えられている。
アニメ版で人間界のアパートに住み着く花魁風のろくろ首として登場する（第23話ほか）。
アニメ版では、原作初期から登場。人魂の天ぷらを使う設定はそのまま踏襲されている。
アニメ版では、他の物体に憑依する妖怪として第2〜5作に登場する。
アニメ版では、死体に魂を乗り移らせる三つ目の鳥のような妖怪として登場する。
実写映画では西田敏行が演じた。アニメでも炎を纏った車輪の妖怪として繰り返し登場する。
アニメ版では、田を失った恨みから凶暴化した一つ目の妖怪として複数作に登場する。
アニメ第5作に、海沿いを七人一組で徘徊する死霊として登場する。
アニメ版では、旋風とともに現れ肌を斬りつける妖怪として複数作に登場する。
アニメ版では、見るたびに巨大化する一つ目の法師姿の妖怪として、呼吸に関わる術を使う設定で登場する。
アニメ版では、弁舌と策略で強者に取り入る妖怪として、骸骨の女性の姿で登場する。
アニメ版では、太古から生きる毛むくじゃらの妖怪として、対象を古代生物に変える力を持つ設定で登場する。
アニメ版では、野晒しの死者の怨念から生まれた妖鳥として、獲物をいつまでも追い続ける設定で登場する。
アニメ版では、井戸に現れる死者の魂の集合体として登場する。
アニメ版では、毒気で人を狂わせる妖怪として、百年ガマの姿に変えられていたという設定で登場する。
アニメ版では、大きな声で人を脅かす妖怪として、姿を見せないことを定めとする設定で登場する。
アニメ版では、河原で小豆を洗う妖怪として、原作では人間への報復者として登場する回もある。
アニメ版では、樹上から落ちてくる巨大な頭だけの妖怪として、第5作では雑貨屋を営む設定で登場する。
アニメ版では、両の掌に目がある妖怪として、手を操る術で人を苦しめる姿で登場する。
実写映画『ゲゲゲの鬼太郎』で、濡れ女に魂を集めさせるという重要な役割を持つキャラクターとして登場する。
呼子・山彦・山小僧として、鬼太郎父子と同じ場所に暮らす仲間の妖怪の一体で登場する。
鬼太郎を乗せて空を飛ぶ主要な仲間として、原作・アニメを通じて一貫して登場する。
鬼太郎たちの母親的存在として、シリーズによっては妖怪アパートの大家役で登場する。
『ゲゲゲの鬼太郎』シリーズで日本妖怪の総大将・鬼太郎の宿敵として繰り返し登場する。
ここから先は、この台帳の妖怪図鑑にはまだ記事がない、鬼太郎シリーズ独自のキャラクターたち。鬼太郎本人やねずみ男のような主要キャラクターから、各話にだけ登場するゲスト妖怪まで、できるだけ多く拾った。